Jan Nowicki po raz ostatni ożenił się w 2016 roku. Anna Kondratowicz była drugą żoną aktora (pierwszą była Małgorzata Potocka), jednak Nowicki przez lata był w związkach z różnymi kobietami. Oto one.
Barbara Janiszewska-Sobotta była polską lekkoatletką pochodzącą z Poznania. Jan Nowicki poznał sportsmenkę na basenie i podobno, gdy tylko ją zobaczył, stwierdził: "To będzie matka mojego dziecka". I faktycznie w 1973 roku na świat przyszedł jego syn Łukasz Nowicki. Aktor był jednak nieobecnym ojcem, gdyż w tym samym czasie zaczęła się rozwijać jego kariera aktorska – i to na nią postawił.
Irena Paszyn była dyrektorką Muzeum Zamoyskich w Kozłówce, którą Nowicki poznał na planie filmu "Anatomia miłości" Romana Załuskiego, w którym jego partnerką na planie była Barbara Brylska. Nowicki nie ożenił się z Paszyną, ale para doczekała się córki Sajany.
Nowicki przez prawie 30 lat był w związku z węgierską reżyserką Marta Mészáros, z którą zrealizowali wspólnie wiele filmów (m.in. nagrodzony w Cannes "Dziennik dla moich dzieci" oraz "Córy szczęścia"). Para wielokrotnie schodziła się i rozstawała. – Jeżeli mam o coś żal, to tylko o to, że rozstaliśmy się nieelegancko. Cóż, ja myślę, że on nie potrafi kochać ludzi. Chociaż chce. Nie potrafi stworzyć ciepłych relacji ze swoim otoczeniem – powiedziała Mészáros po latach w wywiadzie.
Jan Nowicki poślubił Małgorzatę Potocką 16 maja 2009 roku. Ich małżeństwo przetrwało jednak zaledwie sześć lat. Zdaniem słynnej choreografki i założycielki legendarnego zespołu tanecznego "Sabat" poróżniły ich różnice w aktualnych aspiracjach.
– Nie byliśmy w stanie zbudować silnego związku z prozaicznych powodów. Ja mieszkam w Warszawie, tu mam swoje miejsce, swoją scenę. Jan nie mógł zrozumieć mojego poświęcenia dla teatru. Jemu to już dawno przeszło, chciał żyć bez zobowiązań i spacerować po Plantach – opowiadała w wywiadzie.
Drugą żoną aktora, z którą był do śmierci, była Anna Kondratowicz. Kobieta wcześniej pracowała jako menadżerka Nowickiego – uczucie narodziło się pomiędzy nimi dopiero później i para stanęła na ślubnym kobiercu (w tajemnicy) w 2016 roku. Po raz pierwszy pokazali się publicznie na Festiwalu Reżyserii Filmowej w Wałbrzychu w czerwcu 2018 roku.
Dla żony Nowicki przeprowadził się z ukochanego Krakowa do Kielc. – Wiem, że historia i wspaniała architektura mają wielką wartość. Wiem, że z Krakowa człowiek nigdy nie wyprowadza się emocjonalnie – stwierdził.
Jan Nowicki zmarł 7 grudnia w wieku 83 lat w swoim domu we wsi Krzewent, w której się urodził. Na co zmarł Nowicki? Na chwilę obecną informacja ta nie została podana do wiadomości publicznej.
Aktor już jakiś czas temu przyznał, że zmaga się z problemami z pamięcią, jednak nie wiadomo, czy były one spowodowane wiekiem czy konkretną chorobą. W programie "Rozmowa bez faulu" powiedział Małgorzacie Domagalik, że w ostatnim czasie łatwiej przychodzi mu pisanie niż mówienie.