W 1998 r. do kin wszedł także pełnometrażowy film "Z Archiwum X: Pokonać przyszłość", a dziesięć lat później, przeszło sześć lat po emisji ostatniego odcinka serii, na dużym ekranie po raz pierwszy wyświetlono drugi pełnometrażowy obraz "Z Archiwum X: Chcę wierzyć", którego fabuła jest luźną kontynuacją
serialu.