Na dotacje w 2018 roku ministerstwo ma przeznaczyć 11,5 miliona złotych. W następnym roku będzie to już 40,5 miliona złotych. W 2020 roku budżet państwa ma wesprzeć Muzeum kwotą kolejnych 48 milionów złotych. Z drugiej strony jednak także ma pojawić się finansowy wkład.
Fundacja Tadeusza Rydzyka ma przekazać muzeum "w nieodpłatne użyczenie" kaplicę i bibliotekę, których roczna wartość wynosi razem niecałe 370 tys. zł.
Lux Veritatis przekaże Ministerstwu także "projekt koncepcji Muzeum, projekt koncepcyjny ekspozycji stałej i projekt plastycznej aranżacji ekspozycji stałej, uzgodnionej z Ministerstwem" warty 8 milionów złotych. Fundacja ma przekazać także zbiory muzealne, wycenione przez nią samą na 100 milionów złotych.